Om nog even in te gaan waarom het intercept geen error is: het is geen variantie.
Het intercept is een soort 'anker' voor de regressie-vergelijking. De variantie vindt plaats rondom dat intercept. Als je al je variabelen standaardiseert in regressie- en variantie-analyse (die 'achter de schermen' hetzelfde zijn) is het intercept nul, want dan geldt dat als al je voorspellers 0 zijn, je beste voorspelling van de afhankelijke variabele 0 is. Je model verklaart dan echter nog evenveel variantie. Er is niet opeens minder variabiliteit in scores om te verklaren.
Het intercept zegt niets over de variabiliteit in je scores; die zegt alleen "om" welk getal die variabiliteit zich zo ongeveer bevindt.
De toets van het intercept in een anova is of het algemeen gemiddelde van de afhankelijke variabele in de populatie gelijk is aan 0. Je weet in bijna alle gevallen van te voren al zeker dat dat niet zo gaat zijn, dus zoals Ron zei, dit is geen interessante toets.