Kort antwoord: de volgorde maakt niet uit, mits je de juiste interpretatie aan de getallen geeft.
Lang antwoord:
Er zijn geen echte regels voor; zoals je merkt zal enkel het teken van de t-waarde omdraaien (negatief of positieve t-waarde). Het is daarom altijd belangrijk om bij een interpretatie van de t-toets ook te evalueren of de toetsresultaten de 'juiste' richting op staan. Als je verwacht dat mannen meer eten dan vrouwen, dan verwacht je dat de t-toets een teken laat zien in de juiste richting.
Het is dan ook vaak de hypothese die leidend is bij het bepalen van de eerste groep en de tweede. Aangezien groep 1 - groep 2 wordt genomen in het berekenen van de t-waarde kiest men vaak zo dat de 'meer dan' groep in de hypothese groep 1 is, zodat men zich niet laat verwarren bij de interpretatie.
Bijvoorbeeld: hypothese is mannen eten meer boterhammen dan vrouwen (M > V). Als mannen groep 1 zijn, dan zal waarschijnlijk de t-waarde positief zijn (M > V), als de t-waarde dan negatief is dan weet ik dat M < V. Als ik per ongeluk mannen groep 2 maak, dan wordt in de formule V - M gedaan en dan betekent een negatieve t-waarde dat M > V, en een positieve t-waarde dat M < V.