Er is (beperkte) vrijheid om eigen hypothesen te kiezen. De vrijheid is in die zin beperkt dat de hypothesen voort moeten komen uit de inleiding; er kunnen geen variabelen worden toegevoegd die niet in de data staan, en hypothesen moeten enigszins logisch zijn op basis van de theorie.
Dus eigenlijk is de vrijheid om hypothesen te kiezen redelijk illusoir. Om het in de termen van zelfdeterminatie theorie uit te drukken (Ryan & Deci, 2001): het betreft hier waargenomen autonomie (in tegenstelling tot werkelijke autonomie)